每个玩家均可以在第二银河世界挑选一个空间站安放个人基地，只有个人基地才能进行道具存储，科研、破译等事务，以下是个人基地的部分功能的简单介绍。
科研：在这里可以提升指挥官对舰船各个系统的操控能力，以及提升个人基地的生产能力和雇佣舰长的能力等。
破译：在日常游戏中，会获得一些需要进行破译的补给箱，可以使用破译系统进行破解打开，打开后可获得补给箱内的道具。
仓库：存储所有获得的道具的地方。
雇佣舰长：可在此处管理所有雇佣的舰长，对雇佣的舰长进行能力提升和改造。
开发：可消耗低级植入体或者低科技等级蓝图在这里开发获得更好的植入体和高科技等级的物品蓝图。
生产：根据蓝图，消耗材料生产对应的道具。
舰队派遣：派遣雇佣的舰长执行矿物开采和星系悬赏任务。
停机坪：停放舰船以及对舰船进行装配的地方。
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